Current Lectures and Courses

Summer semester 2010 (FU Berlin)

• Algorithmische Systembiologie
• Softwarepraktikum Workflows für Multidomänproteine

Winter semester 2009/2010 (FU Berlin)

• Sequence analysis and molecular evolution

Materialsammlung / Course Materials

• Skript zu den Themen Markovprozesse und Evolution von Sven Rahmann
• Ratschläge für gute Seminarvorträge von W. Huisinga
• Online Lectures on Bioinformatics

Former Courses

Summer semester 2009 (FU Berlin)

• Algorithmische Systembiologie
• Softwarepraktikum Evolution von Proteinkomplexen

Winter semester 2008/2009 (FU Berlin)

• Algorithmische Bioinformatik
  für Studierende des Bachelor Studiengangs Bioinformatik an der FU Berlin
  

• Statistical methods in genetics and bioinformatics: Pattern Recognition and biological data analysis
  für Studierende des Master Studiengangs Bioinformatik an der FU Berlin und IMPRS
  

• Introduction to Epigenetics II / Epigenetics of human diseases and computational investigations
  für Studierende des Master Studiengangs Biologie an der FU Berlin
  

Summer semester 2008 (FU Berlin)

• Systems Biology
• Lev Levitin's lectures on Information Theory
  (IMPRS-CBSC and FU Bioinformatics Master program)

Winter semester 2007/2008 (FU Berlin)

• Probability and Statistics for Sequence Analysis
  (FU Bioinformatics Master program and IMPRS-CBSC program) by Prof. Martin Vingron and Utz J. Pape
• Introduction to DNA methylation and its impact on gene regulation
  (FU Bioinformatics Master program and IMPRS-CBSC program) by Christine Steinhoff
• Simulation of Distributions and Monte-Carlo Methods
  Softwarepraktikum for students in the 5th semester by Prof. Martin Vingron and Utz J. Pape
• Phylogenetische Profile Softwarepraktikum, by Dr. Roland Krause and Prof. Martin Vingron

Summer semester 2007 (FU Berlin)

• RNA: Algorithms for secondary structure and gene detection (Prof. Clote)
  (FU Bioinformatics Master program and IMPRS-CBSC program)
• Seminar zu aktuellen Themen der Bioinformatik / Discussion of brand new research articles from Recomb 07 (Prof. Vingron, Pape)
  (FU Bioinformatics Master program and IMPRS-CBSC program)
• Genexpression und -regulation (Prof. Vingron, Pape)
  (FU Bioinformatics Master program and IMPRS-CBSC program)

Winter semester 2006/2007 (FU Berlin)

• SWP: Analyse von Genexpressionsdaten
  für Studierende des Bachelor Studiengangs Bioinformatik an der FU Berlin
  
• Algorithmische Bioinformatik
  für Studierende des Bachelor Studiengangs Bioinformatik an der FU Berlin
  
• Theoretical Evolutionary Genetics
  (FU Bioinformatics Master program and IMPRS-CBSC program)

Summer semester 2006 (FU Berlin)

• Algorithms for the reconstruction of phylogeny
  (FU Bioinformatics Master program and IMPRS-CBSC program)

Wintersemester 2005/06 (FU Berlin)

• Seminar über Algebraic Statistics (Schliep)
  
• Praktikum Applied Data Mining (Schliep)
  
• Parts of the course: Algorithmische Bioinformatik held by Knut Reinert.
• Genexpressionsanalyse (für Masterstudenten, VL+Ü)
  
• Algorithms for the computation of phylogenetic trees
  (FU Bioinformatics Master program and IMPRS-CBSC program)

Sommersemester 2005 (FU Berlin)

• Seminar über Information theoretic methods in bioinformatics (Schliep)
• Praktikum über Information theoretic methods in bioinformatics (Schliep)
• Genomische Datenanalyse (Einführung in die Statistik für Bioinformatiker)
• Softwarepraktikum und Begleitseminar für Studierende des Bachelor-Studienganges
  
• Praktikum und Seminar zum Thema "Bioinformatische Verfahren zum Studium der Genregulation"
  

Microarray Analysis

• Courses in Practical DNA Microarray Analysis 2005

Wintersemester 2004/05 (FU Berlin)

• Seminar on Biological Networks (Thomas Manke)
  
• Algorithmische Bioinformatik
  

Sommersemester 2004 (FU Berlin)

• Softwarepraktikum B des Bachelor-Studiengangs, Begleitseminar
• Praktikum und Seminar (Schwerpunkte C,D) "Analyse von Microarraydaten -
  Identifikation chromosomaler Aberrationen anhand von Genexpressionsdaten"
• Vorlesung über Genexpression (Genetik für Bioinformatiker), Stefan Röpcke; Folien in PowerPoint,pdf
  

Wintersemester 2003/04 (FU Berlin)

• Statistics, Probability and Algorithms in Bioinformatics (SPAß); Lecture and exercises.
  (originally "Algorithmen für Stochastik und Stochastik für Algorithmen")
• Verarbeitung von DNA-Microarray-Daten, Vorlesung und Übung
• Parts of the course: Algorithmische Bioinformatik held by Knut Reinert.
• Seminar on Clustering Heterogenous Data.
• Seminar on Statistical Classification: Support Vector Machines and Generalized Linear Models. Jointly with Ehrhard Behrends and Peter Martus. (Thursdays, 14:00, Room: 111, Mathematik)

• Practical short course on Applied Data Mining: Support Vector Machines and Hidden Markov Models. Jointly with Knut Reinert.

• Seminar zur RECOMB 2003

Sommersemester 2003 (FU Berlin)

• Genomische Datenanalyse (Einführung in die Statistik für Bioinformatiker)
• Softwarepraktikum und Seminar zur Biologischen Sequenzanalyse
  • Bitte beachten Sie diese Ratschläge für gute Seminarvorträge
• Statistische Mustererkennung in der Bioinformatik

Wintersemester 2002/03 (FU Berlin)

• Algorithmische Bioinformatik
  • Skript zu den Themen "Markovprozesse" und "Evolution" (von S. Rahmann) als .ps oder .pdf
• Seminar über Markovketten

Weitere Veranstaltungen / Further Courses

• Courses in Practical DNA Microarray Analysis 2004
• Courses in Practical DNA Microarray Analysis 2003
• Courses in Practical DNA Microarray Analysis 2002